* 後妻・[[小金井喜美子]] - [[1870年]]︵明治3年︶[[11月29日]] - [[1956年]]︵昭和31年︶[[1月26日]]。[[森鷗外]]の妹にして随筆家・歌人。著書としては﹃鴎外の思い出﹄﹃森鴎外の系族﹄[[岩波文庫]]、訳詩集﹁於母影﹂他。
* 子・[[小金井良一]] - [[大日本帝国海軍|海軍]][[軍医]][[少将]]、昭和医専（現[[昭和大学]]医学部）教授。妻の[[小金井素子]]は哲学者[[桑木厳翼]]の娘。
* 子長女・柿内田鶴子︵1893年生︶ - [[東京大学|東大]]教授[[柿内三郎]]の妻。・'''柿内三郎''' ︵1882－1967︶の妻。夫の三郎は旧[[田安徳川家]]家臣で資産家の柿内家の三男として生まれ<ref>[https://jahis.law.nagoya-u.ac.jp/who/docs/who8-5816 柿内三郎]﹃人事興信録﹄第8版 [昭和3(1928)年7月]</ref>、東京帝大医科大学卒業後、[[隈川宗雄]]に招かれ講師となり、米国留学を経て同大教授となり、1927年に生化学教室を創設し、日本の生化学研究の基礎作りに貢献した<ref name=koto>[https://kotobank.jp/word/%E6%9F%BF%E5%86%85%20%E4%B8%89%E9%83%8E-1641877 柿内 三郎︵読み︶カキウチ サブロウ]コトバンク</ref>。定年後は[[日本学園中学校・高等学校|日本学園]]校長を務めた<ref name=koto/>。
* 子・星せい（精子） - [[星一]]（[[星製薬]]社長、[[参議院議員]]）の妻。[[星新一]]（[[SF作家]]）は子、[[星マリナ]]（[[翻訳家]]）は孫。
