データ分析の考え方や方法など
このコンテンツ
マイクロアレイを用いたトランスクリプトームの網羅的な測定、
データ解析のための考え方、
実際にどんな方法で計算をしたらいいのか、
等を紹介します。
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マイクロアレイデータの解析
(一)データ解析の前提
●用いられる知的な枠組みについて
●枠組みを考えた先人
●枠組みの優劣
●絶対定量が難しい、という事情
●絶対定量の方法？
(二)データの標準化
●データ分布とノイズレベル
●マイクロアレイデータの標準化
●スカイライト社のアウトプット例
(三)データの違いをどう捉えるか
●データの比較
●補足
●階層型クラスタリングによる視覚化
(四)パラメトリック統計を利用した試験
●その差は有意か
●多重検定問題に関する誤解
●選択された遺伝子群は有意か
(五)遺伝子ネットワーク
●﹁ネットワーク﹂とは
●発見と確認
他のトピックス
●ゲノムとトランスクリプトームの統合
●いかにしてゲノム情報が物質となるか
●ゲノムからのトランスクリプトームの予測 など
Tomokazu Konishi, Dec2008-Jan2009