コンテンツにスキップ

ラビリンチュラ綱

出典: フリー百科事典『ウィキペディア(Wikipedia)』
ラビリンチュラ類から転送)
ラビリンチュラ綱

アプラノキトリウム属 (ラビリンチュラ目)

分類
ドメイン : 真核生物 Eukaryota
階級なし : ディアフォレティケス Diaphoretickes
階級なし : SARスーパーグループ SAR supergroup
階級なし : ストラメノパイル Stramenopiles
: ラビリンチュラ綱 Labyrinthulea
学名
Labyrinthulea Cavalier-Smith, 1986

(Labyrinthulomycetes Arx, 1970)

和名
ラビリンツラ綱、ラビリンチュラ菌綱、ラビリンツラ菌綱、
ラビリンチュラ類 (広義)
英名
labyrinthulomycetes,
labyrinthulids (s. l.)
下位分類

 (: Labyrinthulea[ 1]) (: Labyrinthulomycetes[ 2])  () 1 ([1][2])  ()1 (: thraustochytrids) [3][4] ()  (DHA)  () 

 (: labyrinthulids) [3][4][5] () () [5]

[]

[]


 ()  (1) (Labyrinthula) [1][5][6][7] (2; ) (Sorodiplophrys) [8][9]
1a. オーランチオキトリウム属 (ヤブレツボカビ目)
1b. アプラノキトリウム属 (ラビリンチュラ目) の走査型電子顕微鏡像: 細胞表面は鱗片で覆われている。
1c. アンフィトレマ属 (アンフィトレマ目) の殻: 両端に開口部をもち、生細胞はここから外質ネットを伸ばす。

 ( 23 nm) [1][4][5][7][10] (1b) ([10][11]) [5][7][12] (amoeboid cell) [5] () [13][14] (1c) (exopolysaccharide) [5][15]

[3][4][16] ([17][1]; ectoplasmic net,  network,  thread,  filament) [5][7][18][3][6][7][19][10][4][16] (bothrosome; [17] sagenogenetosome, sagenetosome[6], sagenogen[20]) [5][18][19][21] (Amphifila) [22] ()[5][7][12][19]
2a. ラビリンチュラ属 (ラビリンチュラ目)
2b. ラビリンチュラ属

[3][4][5][7][10][12] (2) net slime molds  slime nets [10][20] (net plasmodium, filoplasmodium) [6] labyrinthus [17] (100 µm/)[3][20]沿[7][10]
3. : 

 (1) [5][5][10] (paranuclear body) [5][5][10] (3)8%82%[5]

 () [23]

[]

4. : A, B

 ()[3][4][5][10][16] (4)[1][5][10] ( proliferous body) [16][24][6]
5. Phycophthorum: 

 () 2[5][6] (5)[1][25][10][10][26]

 () [8][9]

[10]1 ( n= 9)[6][27][28] (4V)[7][19]

[]


[5][10]沿[5][7][10]3.541%[3][10]湿[13][29][29][30][8][ 3]DNA[7][10]

 () [1][3][5][10][20][10][31][32] () [3][32] (-)[3][32][10]

α-[5][3][6][20]

 () [1][7] () [10] (Labyrinthula zosterae)  (Labyrinthula terrestris) [33][34] () (Phycophthorum)[35]1[36][37]綿 ()  () [5][10][38][39][10]

[13][40]

 () [23][41]

 (1RNA2DNA) [3][18]宿[10]

[]


1930西 ()  (eelgrass wasting disease) 1 (Labyrinthula zosterae) [3][6][10][20][42][43]1 (Labyrinthula terrestris)  ()  ( rapid blight disease)[3][34][44] Mucochytrium quahogii  QPX (Quahog Parasite Unknown) [45][46] Aplanochytrium haliotidis [47]

 (DHA)  (DPA) (EPA) (ARA) [5][5][48][49][50]β-[5][48][51] (1)[52][5][48]

[]


 () ()[ 4]  () [1][6][16][53][54][55] () [17][53][56] () [5][10][57]

1970 ()  ()  () 1[10][12][58][59]20[11][60] ()  () [13][61][62]2020[63] ([64] Labyrinthulea[ 1][16][65] Labyrinthulomycetes[ 2])  ([63][64] Labyrinthomorpha[10][ 1][16][65] Labyrinthulomycota[10][66][ 2])  Pseudophyllomitus [67] (Sagenista) [68][ 5]DNA (MAST-4, 7, 8, 9, 10, 11, 20) [70][10][11][60]

 ()[67]2020[10]

[1][3][11] (Schizochytrium, Ulkenia ) [16][71][72][73] (Aplanochytrium, Oblongichytrium) [10] () [13][62][3][5][71][72][74]DNA[10][75]2021 ()
ラビリンチュラ綱
"オブロンギキトリウム目"

オブロンギキトリウム科Oblongichytrium

Stellarchytrium

ラビリンチュラ目

アプラノキトリウム科Aplanochytrium

ラビリンチュラ科Labyrinthula

ヤブレツボカビ目

ヤブレツボカビ科Aurantiochytrium, Schizochytrium, Thraustochytrium, Ulkenia etc.

アンフィトレマ目

ディプロフリス科Diplophrys

アンフィトレマ科Amphitrema, Archerella

アンフィフィラ目

アンフィフィラ科Amphifila, Fibrophrys

ソロディプロフリス科Sorodiplophrys

ラビリンチュラ綱内の系統仮説の一例[10][13][62][74][76][77]

ラビリンチュラ綱の属までの分類体系の一例 (2021年現在)[10][66][76]:綱から科の学名は国際動物命名規約上のものを主とし、[ ] 内に国際藻類・菌類・植物命名規約上のものを示す。

脚注[編集]

注釈[編集]



(一)^ abc

(二)^ abc

(三)^ [9]

(四)^  (Hydromyxomycetes)  (Labyrinthulomycetes) [6][53]

(五)^ [69]

(六)^ Labyrinthulea Levine & Corliss, 1963 [56]

(七)^ "" ("Aplanochytriales"; ) [44]

(八)^ DNA[10][16]

(九)^ [44]

(十)^ [10][70]

(11)^ DNA LAB 1/6/8 [75][77]

出典[編集]



(一)^ abcdefghij  (2005). . In   ().  (4) . . pp. 188189. ISBN 978-4785358273 

(二)^ .  . 20201111

(三)^ abcdefghijklmnopq  (2012). . In   (). . . pp. 73-76. ISBN 978-4864690027 

(四)^ abcdefg, ,  &  () (2013). .   5. . p. 1437. ISBN 978-4000803144 

(五)^ abcdefghijklmnopqrstuvwxyzaaabacadMarchan, L. F., Chang, K. J. L., Nichols, P. D., Mitchell, W. J., Polglase, J. L. & Gutierrez, T. (2018). Taxonomy, ecology and biotechnological applications of thraustochytrids: A review. Biotechnology Advances 36: 26-46. doi:10.1016/j.biotechadv.2017.09.003. 

(六)^ abcdefghijk () 椿  () (1985). . . . pp. 2023. ISBN 978-4061396098 

(七)^ abcdefghijklBeakes, G. W., Honda, D. & Thines, M. (2014). Systematics of the Straminipila: Labyrinthulomycota, Hyphochytriomycota, and Oomycota. In McLaughlin, D. J. & Spatafora, J. W.. THE MYCOTA, volume 7A. Systematics and Evolution Part A. Springer. pp. 39-97. doi:10.1007/978-3-642-55318-9_3 

(八)^ abcDykstra, M. J. & Olive, L. S. (1975). Sorodiplophrys: an unusual sorocarp-producing protist. Mycologia 67: 873-879. doi:10.2307/3758346. 

(九)^ abcTice, A. K., Silberman, J. D., Walthall, A. C., Le, K. N., Spiegel, F. W. & Brown, M. W. (2016). Sorodiplophrys stercorea: another novel lineage of sorocarpic multicellularity. Journal of Eukaryotic Microbiology 63: 623-628. doi:10.1111/jeu.12311. 

(十)^ abcdefghijklmnopqrstuvwxyzaaabacadaeafagahaiajakalamBennett, R. M., Honda, D., Beakes, G. W. & Thines, M. (2017). Labyrinthulomycota. In Archibald, J. M., Simpson, A. G. B. & Slamovits, C. H.. Handbook of the Protists. Springer. pp. 507-542. ISBN 978-3319281476 

(11)^ abcdHonda, D., Yokochi, T., Nakahara, T., Raghukumar, S., Nakagiri, A., Schaumann, K. & Higashihara, T. (1999). Molecular phylogeny of labyrinthulids and thraustochytrids based on the sequencing of 18S RNA gene. Journal of Eukaryotic Microbiology 46: 637-646. doi:10.1111/j.1550-7408.1999.tb05141.x. 

(12)^ abcdMoss, S. (1986). Biology and phylogeny of the Labyrinthulales and Thraustochytriales. The Biology of Marine Fungi. Cambridge University Press. pp. 105-129. ISBN 978-0521308991 

(13)^ abcdefGomaa, F., Mitchell, E. A. & Lara, E. (2013). Amphitremida (Poche, 1913) is a new major, ubiquitous labyrinthulomycete clade. PLoS One 8: e53046. doi:10.1371/journal.pone.0053046. 

(14)^ Lee, J. J., Leedale, G. F. & Bradbury, P., ed (2000). An Illustrated Guide to the Protozoa, Organisms Traditionally Referred to as Protozoa, or Newly Discovered Groups. Blackwell Publishers. p. 1064. ISBN 978-1891276224 

(15)^ Jain, R., Raghukumar, S., Tharanathan, R. & Bhosle, N.B. (2005). Extracellular polysaccharide production by thraustochytrid protists. Mar. Biotechnol. 7: 184192. doi:10.1007/s10126-004-4025-x. 

(16)^ abcdefghi (2013). 1.8.5 . In  (). . . pp. 3941. ISBN 978-4254171471 

(17)^ abcd  () (2000). .  (5) . . pp. 8081. ISBN 978-4785358273 

(18)^ abc ,   &   (2007). . 6: 68-73. doi:10.3118/jjse.6.68. 

(19)^ abcdPorter, D. (1990). Phylum Labyrinthulomycota. In Margulis, L., Corliss, J. O., Melkonian, M. & Chapman, D. J.. Handbook of Protoctista. Jones and Bartlett. pp. 388398. ISBN 978-0867200522 

(20)^ abcdefAlexopoulos, C. J., Mims, C. W. & Blackwell, M. (1996). Phylum Labyrinthulomycota. Introductory Mycology. John Wiley & Sons. Inc., New York. pp. 743750. ISBN 978-0-471-52229-4 

(21)^ Moss, S. T. (1985). An ultrastructural study of taxonomically significant characters of the Thraustochytriales and Labyrinthulales. Bot. J. Linn. Soc. 91: 329357. doi:10.1111/j.1095-8339.1985.tb01154.x. 

(22)^ Dykstra, M. J. & Porter, D. (1984). Diplophrys marina, a new scale-forming marine protist with labyrinthulid affinities. Mycologia 76 (4): 626-632. doi:10.1080/00275514.1984.12023892. 

(23)^ abLara, E. & Gomaa, F. (2017). Symbiosis between testate amoebae and photosynthetic organisms. Algal and Cyanobacteria Symbioses. pp. 399-419. doi:10.1142/9781786340580_0013 

(24)^   (2009). Laby Base.  . 2020115

(25)^ Perkins, F. O. & Amon, J. P. (1969). Zoosporulation in Labyrinthula sp.; an electron microscope study. The Journal of Protozoology 16: 235-257. doi:10.1111/j.1550-7408.1969.tb02265.x. 

(26)^ Barr, D. J. & Allan, P. M. (1985). A comparison of the flagellar apparatus in Phytophthora, Saprolegnia, Thraustochytrium, and Rhizidiomyces. Canadian Journal of Botany 63 (1): 138-154. doi:10.1139/b85-017. 

(27)^ Moens, P. B. & Perkins, F. O. (1969). Chromosome number of a small protist: accurate determination. Science 166 (3910): 1289-1291. doi:10.1126/science.166.3910.1289. 

(28)^ Ganuza, E., Yang, S., Amezquita, M., Giraldo-Silva, A. & Andersen, R. A. (2019). Genomics, biology and phylogeny Aurantiochytrium acetophilum sp. nov.(Thraustrochytriaceae), including first evidence of sexual reproduction. Protist 170: 209-232. doi:10.1016/j.protis.2019.02.004. 

(29)^ ab  (2010).  . . p. 50. ISBN 978-4416210048 

(30)^   &   (2018).  . . p. 96. ISBN 978-4829981542 

(31)^ Bongiorni, L. (2012). Thraustochytrids, a neglected component of organic matter decomposition and food webs in marine sediments. In Raghukuma, C.. Biology of Marine Fungi. Prog. Mol. Subcell. Biol. 53.. Springer. pp. 113. ISBN 978-3-642-23342-5 

(32)^ abc  &   (2007). . 61: 316-320. doi:10.11457/swsj1965.61.316. 

(33)^ Bigelow, D. M., Olsen, M. W. & Gilbertson, R. L. (2005). Labyrinthula terrestris sp. nov., a new pathogen of turf grass. Mycologia 97: 185-190. doi:10.1080/15572536.2006.11832852. 

(34)^ abDouhan, G. W., Olsen, M. W., Herrell, A., Winder, C., Wong, F. & Entwistle, K. (2009). Genetic diversity in Labyrinthula terrestris, a newly emergent plant pathogen, and the discovery of new Labyrinthulid organism. Mycol. Res. 113: 11921199. doi:10.1016/j.mycres.2009.08.002. 

(35)^ Hassett, B. T. (2020). A widely distributed thraustochytrid parasite of diatoms isolated from the Arctic represents a gen. and sp. nov.. The Journal of Eukaryotic Microbiology. doi:10.1111/jeu.12796. 

(36)^ Koske, R. E. (1981). Labyrinthula inside the spores of a vesiculararbuscular mycorrhizal fungus. Mycologia 73 (6): 1175-1180. doi:10.1080/00275514.1981.12021451. 

(37)^ Dyková, I., Fiala, I., Dvořáková, H. & Pecková, H. (2008). Living together: The marine amoeba Thecamoeba hilla Schaeffer, 1926 and its endosymbiont Labyrinthula sp. European Journal of Protistology 44: 308-316. doi:10.1016/j.ejop.2008.04.001. 

(38)^ Azevedo, C. & Corral, L. (1997). Some ultrastructural observations of a thraustochytrid (Protoctista, Labyrinthulomycota) from the clam Ruditapes decussatus (Mollusca, Bivalvia). Diseases of Aquatic Organisms 31: 73-78. doi:10.3354/dao031073. 

(39)^ Jones, G. M. & ODor, R. K. (1983). Ultrastructural observations on a thraustochytrid fungus parasitic in the gills of squid (Illex illecebrosus Lesueur). J. Parasitol. 69: 903911. doi:10.2307/3281055. 

(40)^ Raghukumar, S. (2002). Bacterivory: a novel dual role for thraustochytrids in the sea. Marine Biology 113: 165-169. doi:10.1007/BF00367650. 

(41)^ Gomaa, F., Kosakyan, A., Heger, T. J., Corsaro, D., Mitchell, E. A. & Lara, E. (2014). One alga to rule them all: unrelated mixotrophic testate amoebae (Amoebozoa, Rhizaria and Stramenopiles) share the same symbiont (Trebouxiophyceae). Protist 165 (2): 161-176. doi:10.1016/j.protis.2014.01.002. 

(42)^ Muehlstein, L., Porter, D. & Short, F. (1991). Labyrinthula zosterae sp. nov., the causative agent of wasting disease of eelgrass, Zostera marina. Mycologia 83: 180191. doi:10.1080/00275514.1991.12025994. 

(43)^ Brakel, J., Werner, F.J., Tams, V., Reusch, T.B.H. & Bockelmann, A.C. (2014). Current European Labyrinthula zosterae are not virulent and modulate seagrass (Zostera marina) defense gene expression. PLoS One 9. doi:10.1371/journal.pone.0092448. 

(44)^ abcPreisfeld, A. (2012). Labyrinthulomycota. In Frey, W. (eds.). Syllabus of Plant Families. A. Engler's Syllabus der Pflanzenfamilien Part 1/1. Borntraeger. pp. 94-97. ISBN 978-3-443-01061-4 

(45)^ Bassim, S. & Allam, B. (2018). SNP hot-spots in the clam parasite QPX. BMC Genomics 19: 486. doi:10.1186/s12864-018-4866-8. 

(46)^ Geraci-Yee, S., Brianik, C. J., Rubin, E., Collier, J. L. & Allam, B. (2021). Erection of a new genus and species for the pathogen of hard clams Quahog Parasite Unknown(QPX): Mucochytrium quahogii gen. nov., sp. nov.. Protist 172 (1): 125793. doi:10.1016/j.protis.2021.125793. 

(47)^ Bower, S. M., McLean, N. & Whitaker, D. J. (1989). Mechanism of infection by Labyrinthuloides haliotidis (Protozoa, Labyrinthomorpha), a parasite of abalone (Haliotis kamtschatka) (Mollusca, Gastropoda). Journal of Invertebrate Pathology 53: 401409. doi:10.1016/0022-2011(89)90106-7. 

(48)^ abcAasen, I. M., Ertesvåg, H., Heggeset, T. M. B., Liu, B., Brautaset, T., Vadstein, O. & Ellingsen, T. E. (2016). Thraustochytrids as production organisms for docosahexaenoic acid (DHA), squalene, and carotenoids. Applied Microbiology and Biotechnology 100: 4309-4321. doi:10.1007/s00253-016-7498-4. 

(49)^ Winwood, R. J. (2013). Recent developments in the commercial production of DHA and EPA rich oils from micro-algae. OCL 20 (6): D604. doi:10.1051/ocl/2013030. 

(50)^ life's. life'sDHA. 2020815

(51)^ Aki, T., Hachida, K., Yoshinaga, M., Katai, Y., Yamasaki, T., Kawamoto, S., ... & Ono, K. (2003). Thraustochytrid as a potential source of carotenoids. Journal of the American Oil Chemists' Society 80: 789-794. 

(52)^ Kaya, K., Nakazawa, A., Matsuura, H., Honda, D., Inouye, I. & Watanabe, M.M. (2011). Thraustochytrid Aurantiochytrium sp. 18W-13a accummulates high amounts of squalene. Biosci. Biotechnol. Biochem. 75: 22462248. doi:10.1271/bbb.110430. 

(53)^ abc (2005). . In  ().  (4) . . pp. 3839. ISBN 978-4785358273 

(54)^  ,  ,  ,  ,  ,   &   (1983). . . p. 20 

(55)^ David, J.C. (2002). A Preliminary Catalogue of the Names of Fungi above the Rank of Order.  Constancea, University and Jepson Herbaria. 20201018

(56)^ abLevine, N. D., Corliss, J. O., Cox, F. E. G., Deroux, G., Grain, J., Honigberg, B. M., ... & Merinfeld, E. G. (1980). A Newly Revised Classification of the Protozoa. The Journal of Protozoology 27 (1): 37-58.. doi:10.1111/j.1550-7408.1980.tb04228.x. 

(57)^  ,  ,  ,  ,  ,   &   (1983). . . p. 33 

(58)^ Perkins, F. O. (1972). The ultrastructure of holdfasts,rhizoids, and slime tracks in thraustochytriaceous fungi and Labyrinthula spp. Archiv für Mikrobiologie 84 (2): 95-118. doi:10.1007/BF00412431. 

(59)^ Alderman, D. J., Harrison, J. L., Bremer, G. B. & Jones, E. B. G. (1974). Taxonomic revisions in the marine biflagellate fungi: the ultrastructural evidence. Marine Biology 25: 345-357. doi:10.1007/BF00404978. 

(60)^ abTsui, C. K., Marshall, W., Yokoyama, R., Honda, D., Lippmeier, J. C., Craven, K. D., ... & Berbee, M. L. (2009). Labyrinthulomycetes phylogeny and its implications for the evolutionary loss of chloroplasts and gain of ectoplasmic gliding. Molecular Phylogenetics and Evolution 50 (1): 129-140. doi:10.1016/j.ympev.2008.09.027. 

(61)^ Patterson, D. J. (1989). Chromophytes from a protistan perspective. In Green, J. P. Leadbeater, B. S. C. & Diver, W. L.. The Chromophyte Algae, Problems and Perspectives. Clarendon Press. pp. 357379. ISBN 978-0198577133 

(62)^ abcAnderson, O.R. & Cavalier-Smith, T. (2012). Ultrastructure of Diplophrys parva, a new small freshwater species, and a revised analysis of Labyrinthulea (Heterokonta). Acta Protozool. 51: 291304. doi:10.4467/16890027AP.12.023.0783. 

(63)^ ab, ,  &  () (2013). .   5. . p. 1653. ISBN 978-4000803144 

(64)^ ab  () (2000). .  (5) . . p. 265. ISBN 978-4785358273 

(65)^ ab  (), ed (2005). .  (4) . . p. 397. ISBN 978-4785358273 

(66)^ abThe MycoBank engine and related databases.  Robert, V., Stegehuis, G. & Stalpers, J.. 20201025

(67)^ abCavalier-Smith, T. (2018). Kingdom Chromista and its eight phyla: a new synthesis emphasising periplastid protein targeting, cytoskeletal and periplastid evolution, and ancient divergences. Protoplasma 255: 297357. doi:10.1007/s00709-017-1147-3. 

(68)^ Thakur, R., Shiratori, T. & Ishida, K. I. (2019). Taxon-rich multigene phylogenetic analyses resolve the phylogenetic relationship among deep-branching stramenopiles. Protist 170 (5): 125682. doi:10.1016/j.protis.2019.125682. 

(69)^ Cavalier-Smith, T. (1997). Sagenista and Bigyra, two phyla of heterotrophic heterokont chromists. Archiv für Protistenkunde 148 (3): 253-267. doi:10.1016/S0003-9365(97)80006-1. 

(70)^ abAdl, S. M., Bass, D., Lane, C. E., Lukeš, J., Schoch, C. L., Smirnov, A., ... & Cárdenas, P. (2019). Revisions to the classification, nomenclature, and diversity of eukaryotes. Journal of Eukaryotic Microbiology 66 (1): 4-119. doi:10.1111/jeu.12691. 

(71)^ abYokoyama, R. & Honda, D. (2007). Taxonomic rearrangement of the genus Schizochytrium sensu lato based on morphology, chemotaxonomic characteristics, and 18S rRNA gene phylogeny (Thraustochytriaceae, Labyrinthulomycetes): emendation for Schizochytrium and erection of Aurantiochytrium and Oblongichytrium gen. nov. Mycoscience 48: 199211. doi:10.1007/s10267-006-0362-0. 

(72)^ abYokoyama, R., Salleh, B. & Honda, D. (2007). Taxonomic rearrangement of the genus Ulkenia sensu lato based on morphology, chemotaxonomical characteristics, and 18S rRNA gene phylogeny (Thraustochytriaceae, Labyrinthulomycetes): Emendation for Ulkenia and erection of Botryochytrium, Parietichytrium, Sicyoidochytrium gen. nov.. Mycoscience 48: 329341. doi:10.1007/s10267-007-0377-1. 

(73)^ Doi, K. & Honda, D. (2017). Proposal of Monorhizochytrium globosum gen. nov., comb. nov.(Stramenopiles, Labyrinthulomycetes) for former Thraustochytrium globosum based on morphological features and phylogenetic relationships. Phycological Research 65 (3): 188-201. doi:10.1111/pre.12175. 

(74)^ abTakahashi, Y., Yoshida, M., Inouye, I. & Watanabe, M. M. (2016). Fibrophrys columna gen. nov., sp. nov: A member of the family Amphifilidae. European Journal of Protistology 56: 41-50. doi:10.1016/j.ejop.2016.06.003. 

(75)^ abPan, J., del Campo, J. & Keeling, P. J. (2017). Reference tree and environmental sequence diversity of Labyrinthulomycetes. Journal of Eukaryotic Microbiology 64: 8896. doi:10.1111/jeu.12342. 

(76)^ abcdWijayawardene, N. N., Hyde, K. D., Al-Ani, L. K. T., Tedersoo, L., Haelewaters, D., Rajeshkumar, K. C. ... & Tokarev, Y. S. (2020). Outline of Fungi and fungus-like taxa. Mycosphere 11 (1): 1060-1456. doi:10.5943/mycosphere/11/1/8. 

(77)^ abFioRito, R., Leander, C. & Leander, B. (2016). Characterization of three novel species of Labyrinthulomycota isolated from ochre sea stars (Pisaster ochraceus). Marine Biology 163 (8): 170. doi:10.1007/s00227-016-2944-5. 

関連項目[編集]

外部リンク[編集]