[B! 生物][技術] Cruのブックマーク

「6年解けなかった構造があっさり」──タンパク質の“形”を予測する「AlphaFold2」の衝撃　GitHubで公開、誰でも利用可能に

米Alphabet傘下の英DeepMindが、遺伝子配列情報からタンパク質の立体構造を解析するAI﹁AlphaFold v2.0﹂︵以下、AlphaFold2︶をGitHub上で無償公開し、ネット上で注目を集めている。Twitterを利用する生物系の研究者からは﹁革命的な成果だ﹂﹁これからの研究の前提が変わっていく﹂など、AlphaFold2の予測精度に対して驚きの声が相次いだ。なぜAlphaFold2はこれほどの驚きや賞賛をもって迎えられているのか。タンパク質構造解析の難しさをひも解く。未知の部分が多いタンパク質の構造タンパク質は数十種類のアミノ酸からできており、配列によってさまざまな性質に変化する。例えば筋肉、消化酵素、髪の毛はそれぞれ役割が異なるが、いずれもタンパク質で作られている。タンパク質の構造が分かれば、生体内の化学反応の理解が進む。アルツハイマー型認知症やパーキンソン病

Cru 2021/07/21

これ、どうやって正解と判定してるんだろ？X線回折の結果との照合？それは溶液中の構造と対応とれてるの？

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どこでも切断可能に　ゲノム編集の新手法を開発：朝日新聞デジタル

Cru 2017/12/15

ゲノム編集のエポックかしら

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ゲノム編集技術で遊ぶ : わがまま科学者

今、ゲノム編集技術が大流行していると思います。私も、これを使っています。実は、もう2年以上前にハーバード大学のコアファシリティと一緒に技術を確立しました。ボストンでも、おそらくMITのグループに続く速さだったと思います。最初に、成功した後、ハーバード幹細胞研究所やMGHのグループからもたびたび相談を受けてきました。おそらく、世界的にもこの方法を確立したのは早かったと思います。ところが、この技術があまりに一般的になって陳腐化してしまったので、論文を書くこともできなくなり、結果を捨てるということになってしまいました。そこで、折角ですので、その方法を公開してみたいと思います。この写真は、チロシナーゼ遺伝子を標的とするTALENを使って、チロシナーゼ遺伝子を壊すことで、黒いマウスを白くした結果です。これはあまり効率がよくなく、20-30%くらいの成功率。その後、CRISPRで同様なことをやると、

Cru 2017/09/16

1987年の発見者、反骨で生き残り https://mainichi.jp/articles/20170814/k00/00m/040/099000c

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ペットボトルの樹脂を食べる細菌、日本の研究チームが発見

慶応大学、京都工芸繊維大学などの研究チームが、ペットボトルや衣服の素材に使われるペット樹脂を食べて成長する細菌を世界で初めて発見した。

Cru 2017/03/18

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人工培養された腎臓がマウスに戻され機能する

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Cru 2013/04/17

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リアルタイムPCRアッセイ | Thermo Fisher Scientific - JP

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Cru 2012/10/28

次世代シーケンサ。世の中進歩しとる。いまや溶液中のプロトン一個が検出できるんか。微細化技術の極み。

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