[ニュース] プライム編集技術分野において知財対決を回避しようとする動きが進んでいる : crisp_bio
crisp_bio RIKEN (NISLO, WDCM ...) - NIG (DDBJ/CIB, WDCM, OECD BRC, GBIF, JST BIRD, TPRP ...) - FREE [出典] News “Prime editing deal flurry to nail down patent rights” Arnold C. Nat Biotechnol 2024-04-17. https://doi.org/10.1038/s41587-024-02208-0 プライム編集 [*]分野の開発と応用は活況を呈し、各社は知的財産権 (IP) 対決を避けるために戦略的な選択を迫られている。 [*] 本投稿では、"PE"という表記をDavid Liuらが発明したプライムエディターに限定して使用している。 イリノイ大学のバイオテクノロジーを専門とする弁理士Jacob Sher
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全ゲノム解析で明らかになる日本人の遺伝的起源と特徴
理化学研究所（理研）生命医科学研究センター ゲノム解析応用研究チームの寺尾 知可史 チームリーダー（静岡県立総合病院 臨床研究部 免疫研究部長、静岡県立大学 薬学部ゲノム病態解析講座 特任教授）、劉 暁渓 上級研究員（研究当時：ゲノム解析応用研究チーム 研究員; 静岡県立総合病院 臨床研究部 研究員）、東京大学医科学研究所附属ヒトゲノム解析センター シークエンス技術開発分野の松田 浩一 特任教授らの共同研究グループは、大規模な日本人の全ゲノムシークエンス（WGS）[1]情報を分析し、日本人集団の遺伝的構造、ネアンデルタール人[2]およびデニソワ人[3]由来のDNAと病気の関連性、そしてゲノムの自然選択が影響を及ぼしている領域を複数発見しました。 本研究成果は、日本人集団の遺伝的特徴や起源の理解、さらには個別化医療[4]や創薬研究への貢献が期待されます。 今回、共同研究グループは、バイオバン
[20240406更新] ファイザーが3種類の他家CAR-T細胞療法の治験・開発を進めているCaribou Biosciencesに2,500万ドルを投資 : crisp_bio
crisp_bio RIKEN (NISLO, WDCM ...) - NIG (DDBJ/CIB, WDCM, OECD BRC, GBIF, JST BIRD, TPRP ...) - FREE [注] CB-010; CB-011; CB-012 2024-04-06 CB-010の自己免疫疾患であるループス腎炎 (LN) および腎外ループス (ERL)を適応症とする治験許可申請がFDAにより受理された [出典] Caribou Biosciences 2024-04-04 https://investor.cariboubio.com/news-releases/news-release-details/caribou-biosciences-expands-clinical-development-cb-010-fda 2024-02-15 CB-011のヒト臨床試験からの報告
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２月２４日 ヘビの進化 （２月２３日号 Science 掲載論文他２編） | AASJホームページ
モデルナのmRNAがんワクチンと抗体医薬品「キイトルーダ」の併用で悪性黒色腫の再発・死亡リスクが半減
アメリカのバイオテクノロジー企業・モデルナが開発した実験用mRNAがんワクチンと、ドイツの医薬品メーカー・メルクの抗体医薬品「キイトルーダ」を組み合わせたところ、術後3年以内の悪性黒色腫の再発または死亡のリスクが49％減少したことが示されました。 Moderna And Merck Announce mRNA-4157 (V940) In Combination with Keytruda(R) (Pembrolizumab) Demonstrated Continued Improvement in Recurrence-Free Survival and Distant Metastasis-Free Survival in Patients with High-Risk Stage III/IV Melanoma Following Complete Resection Versus
‘Biocomputer’ combines lab-grown brain tissue with electronic hardware
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１２月１２日 染色体ごとの遺伝子発現調節（１２月７日号 Nature 掲載論文） | AASJホームページ
1万3000年前の大量絶滅は気候変動と人間活動のコンボが原因か - ナゾロジー
世界各地で山火事が相次いでおり、深刻な被害が懸念されています。 アメリカでは20年前に比べて3倍の頻度、そして4倍の規模で山火事が発生しているとも言われていますが、このような大規模な山火事は地球にどのような影響を与えるのでしょうか。 実は気候変動によって増加した山火事と人間活動のコンボが、過去に大量絶滅を引き起こしていた可能性があるようです。 約1万年前〜約1万2000年前、サーベルタイガー、ダイアウルフなどを含む多くの大型生物が絶滅しました。 科学者たちは長年、これらの絶滅の原因は気候変動か人間活動のどちらかにあると考えていました。 しかし、ロサンゼルス自然史博物館らの新しい研究により、人間活動と気候変動の両方が関係していた可能性が示唆されたのです。 この研究は、2023年8月23日付で科学誌『Science』に掲載されました。
ハダカデバネズミの長寿の秘密！老化細胞が細胞死を起こしていた - ナゾロジー
ハダカデバネズミは哺乳類げっ歯目デバネズミ科の動物で、ネズミの一種です。 種類にもよりますが、小さなネズミの寿命は基本的に1～3年ほどです。 一方ハダカデバネズミの寿命は長く、適切な飼育下では37年以上生きることもあります。 また特殊なのは寿命だけでなく、ハダカデバネズミはがんになりにくく、無酸素化で18分も生きられ、痛みに対する耐性も強いということが分かっています。 今回紹介する熊本大学三浦恭子教授らの研究グループの研究では、「なぜハダカデバネズミが他のネズミよりも長生きなのか？」という疑問の解明に挑みました。 すると驚いたことに、ハダカデバネズミは自らの老化細胞を殺していることが判明しました。 この研究は科学雑誌EMBOpressに掲載されています。 https://www.embopress.org/journal/14602075 最長寿齧歯類ハダカデバネズミでは老化細胞が細胞死を
アメリカ疾病管理予防センターが「すべての人への追加接種」を推奨した新型コロナワクチンは以前のワクチンとどう違うのか？
書評 「生物学者のための科学哲学」 - shorebird 進化心理学中心の書評など
生物学者のための科学哲学 勁草書房Amazon 本書は生物学にかかわる科学哲学の主要トピックについて科学哲学者や科学史家たちが解説したもの．編者は科学哲学者のカンプラーキスと生物学者のウレルで，書名にもあるように想定読者としては生物学者が念頭に置かれている． これまでの生物学の科学哲学の入門書だと「種とは何か」「自然淘汰の単位は何か」「系統樹の推定はどのような営みか」「利他行動の進化とマルチレベル淘汰」「発生システム論」などの個別の各論のトピックが主要テーマになっているものが多いが，本書が取り上げるものは必ずしも「生物学の科学哲学」に限らないということで，「説明」「知識」「理論とモデル」「概念」などの基礎ブロック的なテーマが数多く取り上げられていてなかなかハードな内容になっている．原題は「Philosophy of Science for Biologists」． 第1章 なぜ生物学者は科
４月２９日 慢性腎臓病研究の最近の進歩（３月９日 NatureCollection 掲載記事） | AASJホームページ
Nature Collectionというサイトがあり、特集として選んだ様々なテーマについてエディターやライターの記事が集められている。いつも目を通しているわけではないのだが、たまたまウェッブサイトを見ていたら、３月のNature Collectionとして慢性腎臓病（CKD）が特集されており、掲載された１０編の総説の中に、最近注目すべきCKD研究がまとめてあったので紹介することにした。タイトルは「Chronic Kidney Disease:Highlights from research(慢性腎臓病：研究のハイライト)」で、サイエンスライターのMichael Eisensteinが担当してまとめている。 ただ、この記事に行く前にAmanda Keenerにより書かれた「The surprise blockbuster（ブロックバスターの驚き）」について少しだけ紹介しておこう。この記事では
MRIの解像度を従来より6400万倍向上させる技術が登場
生命の本質を分子間の相互作用の中に見出す新しい分野──『相分離生物学の冒険――分子の「あいだ」に生命は宿る』 - 基本読書
マッピング | RNA-seq による遺伝子発現解析
2020.08.12 シークエンシングされたリードは、トランスクリプトの一部となっている。これらのリードの塩基配列とゲノム（リファレンス）配列を比べることで、各々のリードがゲノム上のどの遺伝子領域に由来するのかを明らかにすることができる。このように、リードとゲノム配列を比較して、リードの由来箇所を決めることをマッピングあるいはアラインメントとよぶ。 マッピング用のプログラムとして、STAR、HISAT2、BWA などが有名である。これらのプログラムは、FM index とよばれる文字列検索アルゴリズムを使用してマッピングを行なっている。したがって、これらのプログラムを使用するには、まずゲノム配列を FM index で検索できるように Burrows-Wheeler 変換しておく必要がある。この作業をインデックスの作成などという。インデックスを作成してから、FM index でリードと完全
実験医学別冊：Pythonで実践 生命科学データの機械学習〜あなたのPCで最先端論文の解析レシピを体得できる！
はじめに【清水秀幸】 コード・データのダウンロードについて 第1章 機械学習の概要とライフサイエンス研究への応用【清水秀幸】 1.1 AlphaFold2 の衝撃 1.2 機械学習速習 1.2.1 機械学習とは何か？ 1.2.2 機械学習が行うこと 1.2.3 データの「学習」を紐解く 1.2.4 データを丸暗記してはいけない 1.2.5 機械学習の性能指標 1.2.6 教師なし学習 1.3 深層学習ことはじめ 1.3.1 ニューラルネットワークの基本構造 1.3.2 ニューラルネットワークの学習 1.3.3 さまざまなニューラルネットワーク 1.3.4 転移学習のパラダイム 1.4 生命医科学への機械学習の応用 1.4.1 ゲノム・トランスクリプトームへの応用 1.4.2 タンパク質・創薬への応用 1.4.3 バイオテクノロジーへの応用 1.5 おわりに 第2章 Google Colab
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Antibodies 101: Introduction to Gating in Flow Cytometry
Vibrating pill may give dieters a feeling of fullness, study suggests00848-5)
https://www.cell.com/current-biology/fulltext/S0960-9822(23)00848-5
The Mammoth Meatball