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geneticsに関するnabinnoのブックマーク (173)

  • AWS でのマルチオミクスおよびマルチモーダルデータの統合と分析のためのガイダンス


    ステップ 1 The Cancer Genome Archive (TCGA) からデータを取り込み、フォーマットし、カタログ化します。生データは、TCGAAPI を通じてRegistry of Open Data on AWS (RODA) からプルされます。データは AWS Glue 抽出、変換、ロード (ETL) ジョブで変換され、AWS Glue Crawler でカタログ化されます。これにより、データは Athena でクエリできるようになります。 ステップ 2 The Cancer Imaging Atlas (TCIA) のデータが取り込まれ、フォーマットされ、カタログ化されます。生データは、TCIA API を介して RODA からプルされます。データは AWS Glue ETL ジョブで変換され、AWS Glue Crawler でカタログ化されます。イメージの場所は
    AWS でのマルチオミクスおよびマルチモーダルデータの統合と分析のためのガイダンス

  • ゲノムデータ分析 — AWS HealthOmics — アマゾンウェブサービス

    AWS HealthOmics は、ヘルスケアおよびライフサイエンス組織およびソフトウェアパートナーを支援する新たな専用サービスです。ゲノム、トランスクリプトーム、およびその他のオミクスデータを保存、クエリ、分析し、そのデータから得られたインサイトを活用することで、健康を促進します。このサービスは、大規模な分析や共同研究をサポートしています。

    ゲノムデータ分析 — AWS HealthOmics — アマゾンウェブサービス

  • 新サービスAmazon Omicsについて調べてみた#reinvent | DevelopersIO


    概要図 Amazon Omicsサービス紹介ページに概要図が掲載されています。 引用‥https://aws.amazon.com/jp/omics/ この図について左から順に説明していきます。 二本鎖DNAのアイコン‥RNAやDNAのようなシーケンスデータを表す。これをAmazon Omicsに取り込む Amazon Omics ‥ ゲノミクスやトランスクリプトミクスなどのオミックスデータを保存、クエリ、分析 Sequence store ‥ 大規模解析と共同研究をサポート Bioinformatics workflows‥ インフラストラクチャの自動プロビジョニングとスケーリングにより、分析の実行を簡素化 Variant and annotation data ‥ バリアントとアノテーションのデータを最適化 Multimodal and multiomic analysis &Cl
    新サービスAmazon Omicsについて調べてみた#reinvent | DevelopersIO

  • まあ、なんちゅうか、トラバも盛大に伸びているので、私の書くここまで、..


    まあ、なんちゅうか、トラバも盛大に伸びているので、私の書くここまで、元増田は辿り着かないかもしれませんが・・・ 私はゲノム科学者ですが、元増田の持つ疑問は、別に自然なものだと思うんですよね。というより、ゲノム配列決定が非常に身近になっている昨今、ちゃんと向き合っていかなければならない疑問だと思っています。私は私の持つ知識の範囲で、疑問にお答えしたいと思います。倫理は専門外なので扱いません。タブーとか扱いません。裏の意図を読もうとしているブコメが多数ありましたが、理系なのでよくわかりません。 まず、元増田の挙げているような、運動能力、将棋の能力、見た目の美醜とか、学歴、といったヒト個人ごとに異なる特徴を﹁形質﹂と言います。形質を遺伝学の観点から見ると大きく分けて二つあり、単一遺伝子型︵メンデル型︶と多遺伝子型︵多因子型︶です。 おそらく優生学にせよ遺伝にせよ、専門外の人が通常頭に思い浮かべる
    まあ、なんちゅうか、トラバも盛大に伸びているので、私の書くここまで、..

  • ジャラワ族 - Wikipedia


    ジャラワ族︵Jarawa、またはジャルワJarwa︶とは、インド領アンダマン諸島に住む先住部族の一つである。 ジャラワ語を話す。 現在の人口は250から400人と推定されている。 ジャラワ族は部外者に対して極度の警戒心と敵意を持っているので、彼らの文化・言語・生活様式などはほとんど知られていない。 生活様式[編集] ジャラワ族の体格は小柄で、非常に黒い肌、二重瞼の目、黒い縮れた髪をしている。 現在、アンダマン諸島はインドに属しており、インド政府は部外者の出入りを統制している。 アンダマンの他の種族であるオンゲ族と異なり、インド政府からの管理者さえも激しい抵抗のために彼らと接触できないこともある。 歴史[編集] ジャラワ族は、アンダマン諸島の他の先住部族たちと同じく地球上で最も孤立した種族の一つで、外部との接触をほとんどせずに生活してきた。 近代[編集] 1800年代にインドが英国の統治下に

  • Friedrich Miescher Institute for Biomedical Research - Wikipedia

  • FMI Home page

    The placenta provides oxygen and nutrients to a growing baby, but its early interactions with a mother’s uterus remain an enigma. Working with lab-grown versions of developing placentas, FMI researchers have shed light on some of the mechanisms underlying the earliest stages of gestation, which are crucial for a successful pregnancy. Understanding how the placenta develops and interacts with the i

  • 国立遺伝学研究所

    2024/07/05プレスリリース新着 ヨモギにできる虫こぶの多様性を解明 2024/07/03新着 哺乳動物ゲノムのどこにDNA複製開始領域が存在するのか？（総説論文） 2024/06/14プレスリリース新着 茎の節と節間ができるしくみを解明 ～植物科学の未踏の地「茎の発生学」に挑む～ 2024/06/13プレスリリース新着 「魚のヒレ」 長かったり、短かったり⁉ 仕組みを解明 ―ヒレの多様な形成位置をもたらす単純なシステム― 2024/06/12プレスリリース新着 琵琶湖から新種アザイカワニナを発見 ―カワニナ属2種群の平行的な多様化を示唆― 2024/06/06新着 新しい遺伝子トラップ系統の解析により明らかとなったcsrp3遺伝子の、心臓発生および再生における動的な発現パターンと重要な役割。

  • 国立遺伝学研究所 - Wikipedia


    国立遺伝学研究所構内の一重彼岸枝垂︵2023年4月︶ 国立遺伝学研究所︵こくりついでんがくけんきゅうしょ、英‥National Institute of Genetics︶は、遺伝学や生命科学の研究所で、情報・システム研究機構を構成する大学共同利用機関の一つ。静岡県三島市に所在する[1]。総合研究大学院大学生命科学研究科遺伝学専攻があり、大学院教育も行われている。遺伝学研究所内に日本遺伝学会事務局が置かれている。 国立遺伝学研究所は、生命科学分野における中核研究機関として国際水準の先端的研究に取り組んでいる。また、生命科学を支える中核拠点として、バイオリソース事業、日本DNAデータバンク︵DDBJ︶事業、DNAシーケンシング事業を行っている。 具体的な例としては、1950年代から日本の研究者が世界各地から集めた稲野生種を多数保管・栽培しており、栽培種の起源探求のほか、病害や塩害に強い品種改
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  • リボ核酸 - Wikipedia


    リボ核酸︵RNA: Ribonucleic acid︶は、リボースを糖成分とする核酸である。リボヌクレオチドが多数重合したもので、一本鎖をなし、アデニン、グアニン、シトシン、ウラシルの四種の塩基を含む。 一般にDNA︵デオキシリボ核酸︶を鋳型として合成され、その遺伝情報の伝達やタンパク質の合成を行う。 核酸は1868年︵一説によると1869年︶にフリードリッヒ・ミーシャーにより発見された。細胞核内から発見されたため、核酸と命名された。その後、核を持たない原核生物からも核酸が発見されたが、名称が変わることはなかった。1939年、Torbjörn Caspersson、Jean Brachet、Jack Schultz らによりRNAがタンパク質合成に関与しているという説が提唱された。その後 Hubert Chantrenne はRNAがリボソームに対してタンパク質情報を伝達するという役割があ
    リボ核酸 - Wikipedia

  • 伝令RNA - Wikipedia


    真核細胞のmRNAのライフサイクルを示す模式図。mRNAは細胞核内でDNAから転写されて作られる。次に転写後修飾︵プロセシング︶が行われ、細胞質へ輸送される。その後mRNAはリボソームやtRNAと相互作用して翻訳され、タンパク質(またはペプチド)分子が作られる。最終的にmRNAは分解される。 分子生物学において、伝令RNA︵でんれいアールエヌエー、英: messenger ribonucleic acid︶は、mRNAまたはメッセンジャーリボ核酸とも呼ばれ、タンパク質を合成する過程でリボソームによって読み取られる、遺伝子の遺伝子配列に対応する一本鎖のリボ核酸︵RNA︶分子である。 mRNAは、RNAポリメラーゼという酵素が遺伝子を一次転写産物のmRNA前駆体︵pre-mRNA︶に変換する転写過程で作られる。このpre-mRNAには通常、最終的なアミノ酸配列をコードしないイントロンという領域
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  • デオキシリボ核酸 - Wikipedia


    デオキシリボ核酸︵デオキシリボかくさん、英: deoxyribonucleic acid、DNA[1]︶は、2本のポリヌクレオチド鎖が互いに巻きついて二重らせんを形成しているポリマーである。このポリマーは、すべての既知の生物と多くのウイルスの発生、機能、成長、および生殖のための遺伝的命令を伝達する。DNAはリボ核酸︵英: ribonucleic acid、RNA︶とともに核酸と総称される。核酸はタンパク質、脂質、複合多糖と並んで、すべての既知の生命体にとって不可欠な4大生体高分子のひとつである。 DNAの二本鎖は、ヌクレオチドと呼ばれるより単純な単量体単位から構成されていることから、ポリヌクレオチドと呼ばれる[2][3]。各ヌクレオチドは、4つの窒素含有核酸塩基︵シトシン: C、グアニン: G、アデニン: A、チミン: T︶のうちの1つ、デオキシリボースと呼ばれる糖、およびリン酸基で構成さ
    デオキシリボ核酸 - Wikipedia

  • 生物の寿命はDNAに書き込まれている。それによると人間の寿命は38年

    Lifespan of Animals Is Written in Their DNA: For Humans It's Just 38 Years 自然のままなら、人間の寿命は約38年──DNAの解析でさまざまな種の寿命を推測する新手法で導き出された数字だ。 すでにだいたいの寿命がわかっている種の遺伝子研究から推定したところ、絶滅したケナガマンモスの寿命はおそらく60年ほど、シロナガスクジラに次いで大きいホッキョククジラは2世紀半以上長生きできることが判明した。 12月12日付の科学誌サイエンティフィック・リポーツに発表された論文で、研究者たちは動物が年を取るにつれてDNAがどのように変化するかを調べた。そして、このDNAの変化は寿命と関連していることを突き止めた。 老化の謎 老化のプロセスは、生物医学や生態学の分野で非常に重要なテーマだ。動物は年と取るにつれ、生体機能が衰えていき、やが

    生物の寿命はDNAに書き込まれている。それによると人間の寿命は38年

  • ミスセンス突然変異 - Wikipedia


    この記事は検証可能な参考文献や出典が全く示されていないか、不十分です。出典を追加して記事の信頼性向上にご協力ください。︵このテンプレートの使い方︶ 出典検索?: "ミスセンス突然変異" – ニュース · 書籍 · スカラー · CiNii · J-STAGE · NDL · dlib.jp · ジャパンサーチ · TWL︵2023年1月︶ ミスセンス突然変異︵ミスセンスとつぜんへんい︶とは、コドン内の塩基の置換によって異なったアミノ酸残基が合成中のポリペプチド鎖に入り、異常蛋白質が産生されること。点突然変異の一種である。 鎌状赤血球貧血症がその例である。 正常型 DNA 3'-TGA GGA CTC CTC-5' mRNA

  • ウイルス - Wikipedia


    ウイルス︵英語: virus︹ヴァイラス[3]︺, ラテン語: virus︹ウィールス[3]︺, 中国語: 病毒︶は、他生物の細胞を利用して自己を複製させる、極微小な感染性の構造体で、タンパク質の殻とその内部に入っている核酸からなる。ウイルスは1930年代に電子顕微鏡が用いられるようになったことで観察が可能になり、その存在が知られるようになった。 生命の最小単位である細胞やその生体膜である細胞膜も持たないこと、小器官がないこと、自己増殖することがないことから、生物かどうかについて議論がある[4]。一般的には﹁ウイルスは生物ではない﹂とされるが、フランスの進化生物学者パトリック・フォルテールのように、生物に含める見解もある。ウイルスが宿主に感染した状態︵ヴァイロセル、virocell︶を本来の姿と捉えれば生物のようにふるまっていること、ミミウイルスのように多数の遺伝子を持った巨大なウイルスも
    ウイルス - Wikipedia

  • ポリメラーゼ連鎖反応 - Wikipedia


    ﹁PCR検査﹂はこの項目へ転送されています。新型コロナウイルス感染症および新型コロナウイルスに関する臨床検査については﹁COVID-19の検査﹂をご覧ください。 100μLの反応混合物が入っている8連PCRチューブ 卓上型PCR装置 ポリメラーゼ連鎖反応︵ポリメラーゼれんさはんのう、英語: polymerase chainreaction︶とは、DNAサンプルの特定領域を増幅させる反応。 一般的には数百万〜数十億倍に増幅する。英語読みもされるが、その頭文字を取ってPCR法、あるいは単純にPCRと呼ばれることが多い[1][2]。 解説[編集] DNAポリメラーゼと呼ばれる酵素の働きを利用して、一連の温度変化のサイクルを経て任意の遺伝子領域やゲノム領域のコピーを指数関数的に増幅することで、少量のDNAサンプルからその詳細を解析するに十分な量にまで増幅することが目的である[3][4][5]。医
    ポリメラーゼ連鎖反応 - Wikipedia

  • A new treatment promises to make little people taller. Is it an insult to 'dwarf pride'?

  • コスモ・バイオ株式会社 -生命を科学する-

    サイトマップ 当サイトについて 個人情報保護方針 不正防止の基本方針 公的研究費の間接経費に関する基本方針 コミュニティガイドライン 商品の法令対応について 関連リンク 従業員向け災害情報 ※当社のWEBサイトはユーザーの利便性を最適にし、それを保証するためにクッキーを使用しています。 このWEBサイトの利用を継続することで、クッキーの使用に同意することになります。

    コスモ・バイオ株式会社 -生命を科学する-

  • 特集：CRISPR-Cas9 とは DNA二本鎖を切断してゲノム配列の任意の場所を削除、置換、挿入することができる新しい遺伝子改変技術 | DNA二本鎖を切断してゲノム配列の任意の場所を削除、置換、挿入することができる新しい遺伝子改変技術 | コスモ・バイオ株式会社


    DNA二本鎖を切断してゲノム配列の任意の場所を削除、置換、挿入することができる新しい遺伝子改変技術 特集‥CRISPR-Cas9 とは DNA二本鎖を切断してゲノム配列の任意の場所を削除、置換、挿入することができる新しい遺伝子改変技術 CRISPR-Cas9︵clustered regularly interspaced short palindromic repeats / CRISPR associated proteins︶とは、DNA二本鎖を切断︵Double Strand Breaks=DSBs︶してゲノム配列の任意の場所を削除、置換、挿入することができる新しい遺伝子改変技術です。ZFN、TALENに続く第3世代のゲノム編集ツールとして2013年に報告されたCRISPR-Cas技術は、カスタム化︵標的遺伝子の変更や複数遺伝子のターゲット︶が容易であることから、現在、ヒトやマウスと

  • 遺伝子工学 - Wikipedia


    遺伝子銃を使用してDNAを植物組織に挿入する。 遺伝子工学︵いでんしこうがく、英‥genetic engineering︶とは、遺伝子を人工的に操作する技術を指し、特に生物の自然な生育過程では起こらない人為的な型式で行うことを意味している。遺伝子導入や遺伝子組換え︵いでんしくみかえ‥組換えDNA︵くみかえDNA︶︶などの技術で生物に遺伝子操作︵いでんしそうさ︶を行う事を一般に指す。 語源[編集] 遺伝子工学という語の初出はSF作家のジャック・ウィリアムスンが1951年に著した﹃Dragon's Island﹄とされる[1]。 概要[編集] 遺伝子工学は、DNAを分離し、操作し、細胞もしくは生物に再導入して、そのDNAが増殖できるようにする過程からなる。細胞中で、タンパク質の構造は、DNAの配列によって決定されるため、DNA操作によってタンパク質の改変や、新たなタンパク質を発現することができ
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