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システム生物学って何だったんですか？(前編)

29users

zenn.dev/crmind はじめにシステム生物学(systems biology)が提唱され(1998年)てすでに25年が経過しました。諸外国をみると例えばUKなどではsystems biologyやその派生分野 (例えばsystems immunology)が比較的頻繁に使われ分野名として根付いているようであるのに対し、日本ではシステム生物学を標榜する研究室は思ったよりも少ないです。一方で、システム生物学が目指した研究の方向性は、定量生物を始めとして国内においても自然に受け入れられ普及しています。つまり名実でいえば実は十分伴っているように見受けられます。そして、新たにシステム生物学入門の教科書が出版されたように、若い世代にはそれ以上の世代(2023年現在40, 50代の世代)と比較して、システム生物学という語に良い意味でも悪い意味でも特別な印象は持ってないように見受けられます。システム生物学の黎明期からこの ● テクノロジー ●2023/12/02 08:37 ●科学 ●あとで読む ●システム ●生物 ●AI ●研究 ●news

複雑系はなぜ廃れてしまったか？(私的考察)

66users

zenn.dev/crmind 一時は一斉を風靡した複雑系がなぜ廃れてしまったのか？ということについて、Twitter上で私見をツイートしたところ、全く想定していなかった反響があったので、内容を一応メモとしてまとめておきます。背景 Twitter上での科学哲学の議論の中で、複雑系も科学哲学的な側面を多分に持っていること、そして重要な問題を提起していたが、相対的に解けた問題や体系化できた結果がなかったので衰退した、という趣旨のツイートをしました。以下はその衰退について来た質問に答える形で連投したツイートした内容です。このメモはそれをまとめて追記しています。前提自分は複雑系ブームのピークが過ぎた2000年に修士1年でした。複雑系の薄暮を学生として見つつ、別分野(システム生物学)などに取り組んだ世代です。また複雑系研究を牽引していた金子先生や池上先生らの研究室出身ではないです。ですので以下は、そういった研究室の中から ● テクノロジー ●2021/08/03 19:42 ●複雑系 ●科学 ●学問 ●science ●サイエンス ●あとで読む ●*あとで読む

細胞の理論生物学の学び方(学部前期向け)

8users

zenn.dev/crmind 独学をする時の注意点ここに記載した教科書はあくまで目安です。前提となる知識や定番の記法やお約束がわからずに教科書や論文を読んでも理解はできません。特に初学の場合は、自分に馴染みのある問題を手がかりにした教科書を探すほうが早いです。いきなり分野の名著を無理に読むより、学生向けに書いたテキストのほうがよっぽど理解は進みます。また数学や物理の基礎の場合は、必ずしも最新の教科書がいいわけではなく、昔の教科書のほうが良いこともしばしばあります。今の自分にあった教科書を見つけられるのは自分だけなのです。数学基礎理論生物学の教科書を読む場合、どうしても最低限必要となる数学(微分方程式・線形代数・ベクトル解析・確率統計など)があります。ここではその基礎的な数学をまとめます。また志賀先生の30講シリーズは、数学的厳密さより各分野の気持ちを重点的に記載しており副読本として使うととてもよいです。数 ● 学び ●2021/04/02 17:29 ●本 ●統計 ●生物

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