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●種の起原をもとめて-ウォーレスの﹃マレー諸島﹄探検 朝日新聞社 1997.5、オンデマンド版2007/筑摩書房︿ちくま学芸文庫﹀ 2001.6
●進化論の時代-ウォーレス=ダーウィン往復書簡 みすず書房 2010.3。編訳解説
年少者向け
●とっかりぽっかり 文研出版 1978.1
●ダーウィン チャイルド本社 1986.9 (チャイルド絵本館、徳田秀雄絵)
●いぬ 小学館 1997.12 (どうぶついっぱいずかん)
●ダーウィンのミミズの研究 福音館書店 2000.6 (杉田比呂美絵)
共編著
●流氷が連れてきた動物たち 日本放送出版協会・NHKブックスカラー版 1987.3
●ナチュラリスト入門 春夏秋冬 岩波ブックレット 全4冊 1989
●マルチメディア犬図鑑 中島眞理共編 アスキー 1997.5
●からだの部品事典 岩波ジュニア新書 2004.3
●南部シベリアのヒグマとツキノワグマ その比較生物学的研究 G.F.ブロムレイ 藤巻裕蔵共訳 北苑社 1972
●ヒグマとツキノワグマ ソ連極東南部における比較生態学的研究 G.F.ブロムレイ 思索社 1987.9
●アースマインド 人類はどこへ行くのか マイケル・W.フォックス 笹川平子共訳 講談社 1983.10
●ダーウィンに消された男 アーノルド・C.ブラックマン 羽田節子共訳 朝日新聞社 1984.1/朝日選書 1997.9
●熱帯の自然 アルフレッド・R.ウォレス 谷田専治共訳 平河出版社 1987.1
●熱帯の自然 A.R.ウォーレス ちくま学芸文庫 1998.5
●動物行動学・再考 マリアン・S.ドーキンス 山下恵子共訳 平凡社 1989.5
●フラミンゴの微笑 進化論の現在 上・下 スティーヴン・ジェイ・グールド 早川書房 1989.12/ハヤカワ文庫 2002
●マレー諸島 A.R.ウォーレス ちくま学芸文庫 上・下 1993.8
●進化論と生物哲学 一進化学者の思索 エルンスト・マイア 八杉貞雄共訳、東京化学同人 1994.11
●セルボーンの博物誌 ギルバート・ホワイト 小学館・地球人ライブラリー 1997.4
●ウルトラ・ダーウィニストたちへ 古生物学者から見た進化論 N.エルドリッジ シュプリンガー・フェアラーク東京 1998.10
●生物多様性という名の革命 デヴィッド・タカーチ 日経BP社 2006.3
●神と科学は共存できるか?スティーヴン・ジェイ・グールド 狩野秀之・古谷圭一共訳 日経BP社 2007.10
年少者向け[編集]
●あなたのイヌがわかる本 ブルース・フォーグル 奥山幸子・山下恵子共訳、ダイヤモンド社 1993.2、新版2007
●クマ ヘレン・ギルクス 岩崎書店 1994.3 (ちきゅうのなかまたち)
●動物王国 ジェニー・ウッド 岩崎書店 1994.3 (ちきゅうのなかまたち)
●類人猿 テス・レモン 岩崎書店 1994.3 (ちきゅうのなかまたち)
●動物と植物 デヴィッド・ランバート 岩崎書店 1996.2 (なんでも世界一)
●どうしてうごく?キム・テイラー 岩崎書店 1997.4 (ひらいてみよう!かがくのとびら)
●どうしてとぶ?キム・テイラー 岩崎書店 1997.4 (ひらいてみよう!かがくのとびら)
●犬種別ハンドブック ブルース・フォーグル ダイヤモンド社 1997
ラブラドル・レトリーバー
コッカー・スパニエル
ゴールデン・レトリーバー
ジャーマン・シェパード
ダックスフント
プードル
●恐竜の飼いかた教えます 新版 ロバート・マッシュ 山下恵子共訳、平凡社 2009.3。リチャード・ドーキンス序文
●国立情報学研究所収録論文 国立情報学研究所
- ^ 著書には教授とあるが大学のウェブサイト[1]に特任教授とあるのは著書刊行後に専任教員としては一旦退職し、特任教授に身分変更をしたため。