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「ヌタウナギ」の版間の差分

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=== 高頻度縦列反復配列 ===

=== 高頻度縦列反復配列 ===


''''''({{lang-en-short|highly and tandemly repeated DNA sequence}})1993''E. okinoseanus''2(''E. okinoseanus''Eliminated Element of E. okinoseanusEEEo12)<ref name=Souichirou1993 />EEEo1[[]]BamHI95bpDNAEEEo2Dral85bpDNA2[[]]C816<ref name=SeiKou93 />

''''''({{lang-en-short|highly and tandemly repeated DNA sequence}})1993''E. okinoseanus''2(''E. okinoseanus''Eliminated Element of ''E. okinoseanus''EEEo12)<ref name=Souichirou1993 />EEEo1[[]]BamHI95bpDNAEEEo2Dral85bpDNA2[[]]C816<ref name=SeiKou93 />



''E. burgeri''DNA88.6EEEb1550DNA18.5<ref name=Genetica2001 />EEEb1EEEo2''E. burgeri''EEEo2''Eptatretus okinoseanus''''Eptatretus cirrhatus''Paramyxine atami<ref name=Chromosoma1998 />

''E. burgeri''DNA88.6EEEb1550DNA18.5<ref name=Genetica2001 />EEEb1EEEo2''E. burgeri''EEEo2''Eptatretus okinoseanus''''Eptatretus cirrhatus''''Paramyxine atami''<ref name=Chromosoma1998 />



''Eptatretus cirrhatus''EcoRIEEEo2(EEEo2Dral)23(172bpEEEc161bpEEEc254bpEEEc3)EEEo24<ref name=Chromosoma1998 />EEEo212CEEEc1EEEc3CCEEEc2C()

''Eptatretus cirrhatus''EcoRIEEEo2(EEEo2Dral)23(172bpEEEc161bpEEEc254bpEEEc3)EEEo24<ref name=Chromosoma1998 />EEEo212CEEEc1EEEc3CCEEEc2C()


2010年に台湾産の''Paramyxine sheni''から4つの放出・高頻度縦列配列EEPs1-4を発見し、''Paramyxine sheni''細胞中における分布を解析したという報告がなされた<ref name=ChromosomeRes2010 />。EEPs1-4は全放出DNAの20%から27%を占めており、やはり従来発見されている放出・高頻度縦列配列同様に生殖細胞ゲノムに高いコピー数で縦列配置されている。しかし、体細胞内にも少量ながら存在する。また、EEPs1-4の分布を決定するために行われた[[蛍光遺伝子プローブ法]](FISH)は、生殖細胞の異質染色性染色体だけでなく、真性染色性染色体の両端もP. sheniの体細胞に存在せず、放出されることを示した。このことは、染色体末端の放出、さらには全ての染色体放出が体細胞染色体の分化に寄与することを強く示唆する。さらに、[[テロメア]]のFISHは、染色体の断片化とその後の[[de novo合成]]によるテロメア反復領域の付加が染色体末端の放出のメカニズムの一端である可能性を示した。このため、ヌタウナギ目において、染色体放出は体細胞の分化や進化の過程に深く関わると目されている。


2010''Paramyxine sheni''4EEPs1-4''Paramyxine sheni''<ref name=ChromosomeRes2010 />EEPs1-4DNA2027EEPs1-4[[]]FISH''P. sheni''[[]]FISH[[de novo]]


=== デュアル・エクスプレッション・システム ===

=== デュアル・エクスプレッション・システム ===


2017年9月6日 (水) 01:35時点における版

ヌタウナギ

ヌタウナギの仲間 Eptatretus stoutii

分類
: 動物界 Animalia
: 脊索動物門 Chordata
亜門 : 脊椎動物亜門 Vertebrata
上綱 : 無顎口上綱 Agnatha
: ヌタウナギ綱 Myxini
: ヌタウナギ目 Myxiniformes
: ヌタウナギ科 Myxinidae
学名
Myxinidae
Rafinesque1815[1]
英名
Hagfish

: Hagfish1 Eptatretus burgeri 便[][2][3]


[4]5~270m


[5]200618 (Myxinidae) 20071[6]HagfishSlime eel

Eptatretus minor 

 1-16773-4

退退

姿70-200

()


8(Eptatretus burgeri()E. stoutii(沿)E. okinoseanus()E. cirrhatus()Paramyxine sheni()P. atami()Myxine glutinosa()M. garmani())[7]()([ 1])Eptatretus burgeri36522526[8]16DNADNA79.2%[8]16DNA20.8%16C[ 2](())


(: highly and tandemly repeated DNA sequence)1993E. okinoseanus2(E. okinoseanusEliminated Element of E. okinoseanusEEEo12)[9]EEEo1BamHI95bpDNAEEEo2Dral85bpDNA2C816[7]

E. burgeriDNA88.6EEEb1550DNA18.5[10]EEEb1EEEo2E. burgeriEEEo2Eptatretus okinoseanusEptatretus cirrhatusParamyxine atami[11]

Eptatretus cirrhatusEcoRIEEEo2(EEEo2Dral)23(172bpEEEc161bpEEEc254bpEEEc3)EEEo24[11]EEEo212CEEEc1EEEc3CCEEEc2C()

2010Paramyxine sheni4EEPs1-4Paramyxine sheni[12]EEPs1-4DNA2027EEPs1-4FISHP. sheniFISHde novo


(: dual expression system)2()5S rRNA[ 3]5S rRNA調[7][13]5S rRNA5S rRNA調E. burgeri85S rRNA25S rRNA調25S rRNA5S rRNA[7]5S rRNA5S rRNA2[7](Petromyzon marinus)()2009[14]


7701Eptatretus burgeri 10-270m[15]

5

( ) - 

調鹿



eel skin


Eptatretus cirrhatus
New Zealand hagfish
Eptatretus springeri
Gulf hagfish

 Myxini 112770[2]5[16][16]
  • ヌタウナギ目 Myxiniformes
    • ヌタウナギ科 Myxinidae
      • ホソヌタウナギ亜科 Myxininae 4属25種
        • ホソヌタウナギ属(旧名:メクラウナギ属) Myxine (21種)
          • ホソヌタウナギ(旧名:メクラウナギ) M. garmani
          • オキナホソヌタウナギ M. paucidens
          • M. glutinosa
        • Notomyxine 属 (N. tridentiger 1種のみ)
        • Neomyxine 属 (N. biniplicata 1種のみ)
        • Nemamyxine 属 (2種)
      • ヌタウナギ亜科 Eptatretinae 3属45種
        • ヌタウナギ属 Eptatretus Cloquet, 1819 (33種)
          • ヌタウナギ E. burgeri (Girard1845)
          • ムラサキヌタウナギ E. okinoseanus (Dean, 1904)
          • クロヌタウナギ E. atami (Dean, 1904)
          • E. stoutii
          • E. cirrhatus
        • クロヌタウナギ属 Paramyxine (8種)→ヌタウナギ属のシノニムとすることが多い。
          • P. sheni
        • Quadratus 属 (4種)

脚注



(一)^ (: chromosome elimination)()()1887(Boveri)(Parascaris equorum)

(二)^ C()()CC

(三)^ (rDNA)3rRNArDNA5S rRNArDNA2rDNA120bp5S rRNA(NTS)5S rRNA

出典

  1. ^ "Myxinidae". World Register of Marine Species. 2017年3月26日閲覧
  2. ^ a b Nelson JS, Fishes of the world (4th edn), 2006
  3. ^ 『魚学入門』 pp.1-11
  4. ^ 『新版 魚の分類の図鑑』 pp.2-3
  5. ^ 世界大百科事典 第2版の解説
  6. ^ 日本魚類学会 2007年1月31日 差別的標準和名として改名された魚の名称一覧
  7. ^ a b c d e “ヌタウナギ~二つのゲノムの謎~”. 生物工学会誌2015 93 (1): 45-49. (2015). 
  8. ^ a b Kohno, S.; Nakai, Y.; Satoh, S.; Yoshida, M.; Kobayashi, H. (1986). “Chromosome elimination in the Japanese hagfish, Eptatretus burgeri (Agnatha, Cyclostomata).”. Cytogenet Cell Genetics 41 (4): 209-214. http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed/3709235. 
  9. ^ Souichirou Kubota; Masaki Kuro-o; Shigeki Mizuno; Sei-ichi Kohno (1993). “Germ line-restricted, highly repeated DNA sequences and their chromosomal localization in a Japanese hagfish (Eptatretus okinoseanus)”. Chromosoma 102 (3): 163-173. http://link.springer.com/article/10.1007/BF00387731?no-access=true. 
  10. ^ S. Kubota; J.-i. Takano; R. Tsuneishi; S. Kobayakawa; N. Fujikawa; M. Nabeyama; S.-i. Kohno (319-328). “Highly repetitive DNA families restricted to germ cells in a Japanese hagfish (Eptatretus burgeri): a hierarchical and mosaic structure in eliminated chromosomes”. Genetica 111 (1-3): 2001–. http://link.springer.com/article/10.1023%2FA%3A1013751600787. 
  11. ^ a b “Highly repetitive DNA sequences that are restricted to the germ line in the hagfish Eptatretus cirrhatus: a mosaic of eliminated elements”. Chromosoma1 107 (1): 17-32. (1998). http://link.springer.com/article/10.1007/s004120050278?no-access=true. 
  12. ^ Noriko F. Kojima; Kenji K. Kojima; Shuichi Kobayakawa; Naoki Higashide; Chiemi Hamanaka. et al. (2010). “Whole chromosome elimination and chromosome terminus elimination both contribute to somatic differentiation in Taiwanese hagfish Paramyxine sheni. Chromosome Research 18 (3): 383-400. http://link.springer.com/article/10.1007%2Fs10577-010-9122-2. 
  13. ^ Mika Fujiwara; Junya Inafuku; Akiko Takeda; Akiko Watanabe; Atushi Fujiwara; Sei-ichi Kohno; Souichirou Kubota (2008). “Molecular organization of 5S rDNA in bitterlings (Cyprinidae)”. Genetica 135 (3): 355-365. 
  14. ^ Jeramiah J. Smith; Francesca Antonacci; Evan E. Eichler; Chris T. Amemiya (2009). “Programmed loss of millions of base pairs from a vertebrate genome”. Proceedings of the National Academy of Sciences 106 (27): 11212-11217. http://www.pnas.org/content/106/27/11212.full.pdf+html. 
  15. ^ FishBase entry for Eptatretus burgeri(英語)
  16. ^ a b 後藤友二; 久保田宗一郎 (2015年1月25日). “ヌタウナギ~二つのゲノムの謎~”. 生物工学会誌 Seibutsu-kogaku Kaishi (公益社団法人 日本生物工学会) 93 (1): 45-49. 

参考文献

関連項目

外部リンク