ハプログループC2 (Y染色体)

出典: フリー百科事典『ウィキペディア(Wikipedia)』

ハプログループC-M217 (Y染色体)(ハプログループC-M217 Yせんしょくたい、英: Haplogroup C-M217 (Y-DNA))、系統名称ハプログループC2とは分子人類学において人類の父系を示すY染色体ハプログループ(型集団)の分類で、ハプログループCの下位枝に属し、「M217, P44, PK2」によって定義されるグループである。かつてはハプログループC3と呼ばれていた。

概略[編集]

Y染色体 C-M217 系統
ハプログループC2の分布図
系統祖 C-M130
発生時期 50,865 [95% CI 49,191 ↔ 52,699]年前[1]
発生地(推定) 中央アジアまたはシベリアまたは東アジア北部(アルタイ山脈モンゴル高原付近)
現存下位系統の
分岐開始年代(下限値)
35,383 [95% CI 33,305 ↔ 37,537]年前[1]
親階層 C-M130
分岐指標 M217, P44, PK2
子階層 C2a-L1373, C2b-F1067
高頻度民族・地域 北東アジア中央アジア(カザフスタン)、北アメリカ北西部。
カザフ人モンゴル系民族ツングース系民族古アジア系民族ナデネ系民族に高頻度。

50,865[1]C1-F3393/Z1426C-M21735,383[1]

C2-M217520[2]490[3]450[4]260[4]7.8%12910[3]1028[5][4][6][7] C-M217Y-DNA162 = 12.5%[8]41 = 25%[4])C2-M217[5][3][9]50C-M217714%[10]

各民族の頻度[編集]

ハプログループCの拡散経路

[]


C2C-M217 , , , , , , , , , , , , , , , , , , , , [11][4][8][24][25]
C2aC-L1373
C2a1 (C-F3447)
C2a1a (C-F1699)
C2a1a1C-F3918
C2a1a1aC-P39[26]

C2a1a1b (C-FGC28881.2)
C2a1a1b1 (C-F1756) 
C2a1a1b1a (C-F3830) 

C2a1a1b1b (C-Y10420/Z30402) 1841-1990西

C2a1a2C-M48
C2a1a2aC-M86, , , ,, , , ,, , , , , , , , , [27][28]

C2a1a2b (C-B90) 
C2a1a2b1 (C-B91) 

C2a1a2b2 (C-B93) 

C2a1a3 (C-M504) 
C2b1a3a1c (C-Y12782) 

C2a1a4 (C-Y12018/Z30601) 
C2a1a4c (C-B79) 

C2a2 (C-Z31698) 

C2bC-F1067
C2e (C-F2613/Z1338)
C2e1 (C-Z1300)
C2e1a(C-CTS2657) 7.1%[29]2.18%[30]
C-A14895
C-A14912 

C-Y37069 

C-Z18177
C-Z18177*

C-Y13860
C-CTS4449 ()

C-Y13856/F6319/C-F7940
C-MF1605 0.31%[31]
C-MF1711 [32]

C-MF1601/C-S20873
C-MF1607/C-L1496 [32][33][33][33][33]

C-M407 , , , , ,[34] , , , , , , [24][35]
C-Z45401 [36]西[33][33][33][37][36][32]

C-F3850 [33][33]
C-MF58000 [33][33][33][33][33]

C-F3916/C-Y12960 [32][33]
C-F3881 [36][32][32][33][32][33][33]西[33][33][33]西[33][33][33][33]

C-MF2971/C-MF3103 [33][33][33][33]
C-MF59028 0.45%0.33%0.21%0.14%0.09%[38]
C-MF64016/C-F3753 YCH1483[39]

C-F6480
C-MF4520 [32][33]西[33][33]

C-Y154411/C-FT326881 [33][33]
C-PH85 [32]西[33][33][32]

C-MF747892 [33]
C-MF2845/C-Y138171/C-SK1027 [33]
C-MF2821/C-MF5074 西[33][33](CRR012550=YCH449[32])
C-MF3197 [32][33][33]西[33]西西[33]西西[33]西[33]西[33][33][33][33][33][33][33][33][33][33][33][32][33]

C-MF74872 [36]西[33]西[33]宿[33][33][33][33][33][33][33][33][33]

C-F8465 [32]
C-F9772/C-F9857 [32]
C-F10378 [32][36][32]
C-F9733 [36][32][36][32]

C-Z4328 [36][32][36][32][32]

C-K700/C-Z8440 3.17%[33]2.4%[29]
C-CTS3385 0.64%[33]
C-MF1061
C-MF1061* [32]

C-S3190 [32][32]

C-Y125448 [32][32]西[32][32][32]

C-FGC45553
C-FGC45553* [32]

C-PH1906
C-PH1906* [32]

C-FGC45548
C-Y170884 

C-MF2000 西西

C-PH2194
C-F21131 [32][32]

C-PH1279 [32]

C-FGC45589
C-FTA20473 [32][32][32]

C-Y37829 [32][32][32][32]

C-F1319 2.50%[40]
C-F10056
C-F9765
C-MF3812 

C-MF1882 

C-MF1955 (F9709) 0.15[41]
C-MF3000 (MF1988) 0.03[42][43])

C-MF1960 (MF1963, Y186515, ACT337) [37]西[37][37]涿鹿[37][37][32][37]

C-MF1029 0.45[44]

C-F2883 (F3891)
C-Y35926 [32])
C-F10383 (F3909) [36] ([32][32][36][36][36][36][36]
C-F9898 0.97[][45]

C-F3777
C-F3777* ()

C-F3735 

C2e2 (C-F845) 2.4%[29]2.28%[33]
C-F845* 

C-FGC39579 

C-K511 西

C-F5477
C-MF10318 [32]

C-MF15330 [32]
C-Y241305 [32][32]

C-F14054/C-MF52991 (TMRCA7,070[33]6,483 [99% CI 8,931 - 4,555][36])
C-M93[24][46][37][29][37]西[37]西西[33]

C-F10273
C-Y171915 [32]西[32]

C-SK1038/C-MF1015
C-SK1038* [32]

C-F10352
C-MF10312 [32][32]

C-Y150098 [32][32][32]

C-MF1017
C-Y81534 [32][32]

C-MF1020 [32][32][32][32]

C2b2 (C-CTS4660) [36]0.24[47][36]

Y-DNA Haplogroup C and its Subclades - 2019

[]


C2C-P39Q (Y)QC-M48

C2C-M48C-P39C-L1373C-F1067C-L1373[29]C-M407C-F1067[48][49] C-L1373C-F106734,400[32]35,383 [95% CI 33,305  37,537][1]C-F1067

1000JPT, "Japanese in Tokyo, Japan"562C-M2172016[7] 2C-F1067C-F3850C-F5477/SK1036(xC-F13762)[32]

Sun et al (2020) C2a-L137317,700-14,30025,000[50]

関連項目[編集]

ヒトY染色体ハプログループ系統樹
Y染色体アダム (Y-MRCA)
A0 A1
A1a A1b
A1b1 BT
B CT
DE CF
D E C F
G H IJK
IJ K
I J K1 K2
L T MS NO P K2*
N O Q R

脚注[編集]



(一)^ abcdeMonika Karmin, Lauri Saag, Mário Vicente, et al. (2015), "A recent bottleneck of Y chromosome diversity coincides with a global change in culture." Genome Research 25:18. Published by Cold Spring Harbor Laboratory Press; ISSN 1088-9051/15; http://www.genome.org/cgi/doi/10.1101/gr.186684.114.

(二)^ Sae Naitoh, Iku Kasahara-Nonaka, Kiyoshi Minaguchi, and Phrabhakaran Nambiar, "Assignment of Y-chromosomal SNPs found in Japanese population to Y-chromosomal haplogroup tree." Journal of Human Genetics (2013) 58, 195201; doi:10.1038/jhg.2012.159; published online 7 February 2013.

(三)^ abcdefgh, The Super Science High School Consortium, SSHY DNA 調Anthropological Science (Japanese Series) Vol. 124(2), 8591, 2016. DOI: 10.1537/asj.161018

(四)^ abcdefghijklHammer MF, Karafet TM, Park H et al. (2006). "Dual origins of the Japanese: common ground for hunter-gatherer and farmer Y chromosomes". J. Hum. Genet. 51 (1): 4758. ,doi:10.1007/s10038-005-0322-0. PMID 16328082. 

(五)^ abcdefghijkYOUICHI SATO, TOSHIKATSU SHINKA, ASHRAF A. EWIS, AIKO YAMAUCHI, TERUAKI IWAMOTO, YUTAKA NAKAHORI Overview of genetic variation in the Y chromosome of modern Japanese males. Anthropological Science. 2014 Volume 122, Issue 3, Pages 131-136, doi:10.1537/ase.140709

(六)^ abcdeI. Nonaka, K. Minaguchi, and N. Takezaki, "Y-chromosomal Binary Haplogroups in the Japanese Population and their Relationship to 16 Y-STR Polymorphisms," Annals of Human Genetics (2007) 71,480495. doi:10.1111/j.1469-1809.2006.00343.

(七)^ abcG. David Poznik, Yali Xue, Fernando L. Mendez, et al., "Punctuated bursts in human male demography inferred from 1,244 worldwide Y-chromosome sequences." Nature Genetics (2016) ,doi:10.1038/ng.3559.

(八)^ abcdAtsushi Tajima, Masanori Hayami, Katsushi Tokunaga, Takeo Juji, Masafumi Matsuo, Sangkot Marzuki, Keiichi Omoto and Satoshi Horai, Genetic origins of the Ainu inferred from combined DNA analyses of maternal and paternal lineages, Journal of Human Genetics, Volume 49, Number 4 / April, 2004.

(九)^ abcdefHirofumi Nohara, Ikuko Maeda, Rinnosuke Hisazumi, Taketo Uchiyama, Hiroko Hirashima, Masahito Nakata, Ohno Rika, Tetsuro Hasegawa, and Kenshi Shimizu, "Geographic distribution of Y-STR haplotypes and Y-haplogroups among Miyazaki Prefecture residents." Japanese Journal of Forensic Science and Technology, Volume 26 (2021), No. 1., p. 17-27. https://doi.org/10.3408/jafst.778

(十)^ abcdeSoon-Hee Kim, Ki-Cheol Kim, Dong-Jik Shin, Han-Jun Jin, Kyoung-Don Kwak, Myun-Soo Han, Joon-Myong Song, Won Kim, and Wook Kim (2011), "High frequencies of Y-chromosome haplogroup O2b-SRY465 lineages in Korea: a genetic perspective on the peopling of Korea." Investigative Genetics 2011, 2:10. http://www.investigativegenetics.com/content/2/1/10

(11)^ abcdefghijXue Y, Zerjal T, Bao W et al. (April 2006). "Male demography in East Asia: a north-south contrast in human population expansion times". Genetics 172 (4): 24319. doi:10.1534/genetics.105.054270. PMC 1456369. PMID 16489223.

(12)^ abcdefghijkKarafet T, Xu L, Du R et al. (September 2001). "Paternal population history of East Asia: sources, patterns, and microevolutionary processes". Am. J. Hum. Genet. 69 (3): 61528. doi:10.1086/323299. PMC 1235490. PMID 11481588. 

(13)^ abcdPakendorf B, Novgorodov IN, Osakovskij VL, Stoneking M (July 2007). "Mating patterns amongst Siberian reindeer herders: inferences from mtDNA and Y-chromosomal analyses". Am. J. Phys. Anthropol. 133 (3): 101327. doi:10.1002/ajpa.20590. PMID 17492671.

(14)^ abTatiana M. Karafet, Ludmila P. Osipova, Marina A. Gubina et al., High Levels of Y-Chromosome Differentiation among Native Siberian Populations and the Genetic Signature of a Boreal Hunter-Gatherer Way of Life, Human Biology, December 2002, v. 74, no. 6, pp. 761789.

(15)^ E. V. Balanovska, Y. V. Bogunov, E. N. Kamenshikova, et al., "Demographic and Genetic Portraits of the Ulchi Population." ISSN 1022-7954, Russian Journal of Genetics, 2018, Vol. 54, No. 10, pp. 12451253. doi:10.1134/S1022795418100046

(16)^ abcTajima, Atsushi; Hayami, Masanori; Tokunaga, Katsushi; Juji, T; Matsuo, M; Marzuki, S; Omoto, K; Horai, S (2004). "Genetic origins of the Ainu inferred from combined DNA analyses of maternal and paternal lineages". Journal of Human Genetics 49 (4): 187193. doi:10.1007/s10038-004-0131-x. PMID 14997363. 

(17)^ Wells, Spencer et al. 2001, The Eurasian Heartland: A continental perspective on Y-chromosome diversity

(18)^ abcdZegura SL, Karafet TM, Zhivotovsky LA, Hammer MF (January 2004). "High-resolution SNPs and microsatellite haplotypes point to a single, recent entry of Native American Y chromosomes into the Americas". Mol. Biol. Evol. 21 (1): 16475. doi:10.1093/molbev/msh009. PMID 14595095.

(19)^ Marc Haber, Daniel E. Platt, Maziar Ashrafian Bonab, Sonia. Afghanistan's Ethnic Groups Share a Y-Chromosomal Heritage Structured by Historical Events http://journals.plos.org/plosone/article?id=10.1371/journal.pone.0034288

(20)^ Sengupta S, Zhivotovsky LA, King R et al. (February 2006). "Polarity and temporality of high-resolution y-chromosome distributions in India identify both indigenous and exogenous expansions and reveal minor genetic influence of Central Asian pastoralists". Am. J. Hum. Genet. 78 (2): 20221. doi:10.1086/499411. PMC 1380230. PMID 16400607. 

(21)^ , () 20185, 143

(22)^ abHua Zhong, Hong Shi, Xue-Bin Qi, et al., "Global distribution of Y-chromosome haplogroup C reveals the prehistoric migration routes of African exodus and early settlement in East Asia." Journal of Human Genetics (2010) 55, 428435; doi:10.1038/jhg.2010.40.

(23)^ Tatiana M. Karafet, Brian Hallmark, Murray P. Cox, Herawati Sudoyo, Sean Downey, J. Stephen Lansing, and Michael F. Hammer (2010),Major EastWest Division Underlies Y Chromosome Stratification across Indonesia.Molecular Biology and Evolution 27(8):18331844. doi:10.1093/molbev/msq063

(24)^ abcSanghamitra Sengupta, Lev A. Zhivotovsky, Roy King, S.Q. Mehdi, Christopher A. Edmonds, Cheryl-Emiliane T. Chow, Alice A. Lin, Mitashree Mitra, Samir K. Sil, A. Ramesh, M.V. Usha Rani, Chitra M. Thakur, L. Luca Cavalli-Sforza, Partha P. Majumder, and Peter A. Underhill, Polarity and Temporality of High-Resolution Y-Chromosome Distributions in India Identify Both Indigenous and Exogenous Expansions and Reveal Minor Genetic Influence of Central Asian Pastoralists, The American Journal of Human Genetics, Volume 78, Issue 2, 202-221, 1 February 2006.

(25)^ Wells RS, Yuldasheva N, Ruzibakiev R, et al. (August 2001). The Eurasian heartland: a continental perspective on Y-chromosome diversity. Proc. Natl. Acad. Sci. U.S.A. 98 (18): 102449. doi:10.1073/pnas.171305098. PMC 56946. PMID 11526236. http://www.pnas.org/cgi/pmidlookup?view=long&pmid=11526236. 

(26)^ Zegura SL, Karafet TM, Zhivotovsky LA, Hammer MF (January 2004). High-resolution SNPs and microsatellite haplotypes point to a single, recent entry of Native American Y chromosomes into the Americas. Mol. Biol. Evol. 21 (1): 16475. doi:10.1093/molbev/msh009. PMID 14595095. http://mbe.oxfordjournals.org/cgi/pmidlookup?view=long&pmid=14595095. 

(27)^ Pakendorf B, Novgorodov IN, Osakovskij VL, Danilova AP, Protod'jakonov AP, Stoneking M (October 2006). Investigating the effects of prehistoric migrations in Siberia: genetic variation and the origins of Yakuts. Hum. Genet. 120 (3): 33453. doi:10.1007/s00439-006-0213-2. PMID 16845541. 

(28)^ Khar'kov VN, Stepanov VA, Medvedev OF, et al. (2008). [The origin of Yakuts: analysis of Y-chromosome haplotypes] (Russian). Mol. Biol. (Mosk.) 42 (2): 22637. PMID 18610830. 

(29)^ abcdeSo Yeun Kwon, Hwan Young Lee, Eun Young Lee, Woo Ick Yang, and Kyoung-Jin Shin, "Confirmation of Y haplogroup tree topologies with newly suggested Y-SNPs for the C2, O2b and O3a subhaplogroups." Forensic Science International: Genetics 19 (2015) 4246. doi:10.1016/j.fsigen.2015.06.003

(30)^ https://www.23mofang.com/ancestry/ytree/C-CTS2657/detail

(31)^ https://www.23mofang.com/ancestry/ytree/C-MF1605/detail

(32)^ abcdefghijklmnopqrstuvwxyzaaabacadaeafagahaiajakalamanaoapaqarasatauavawaxayazbabbbcbdbebfbgbhbibjbkblbmbnYFull Haplogroup C-M217 YTree v5.07 at 05 November 2017

(33)^ abcdefghijklmnopqrstuvwxyzaaabacadaeafagahaiajakalamanaoapaqarasatauavawaxayazbabbbcbdbebfbgbhbibjbkblbmbnbobpbqbrbsbtbubv23mofangC-M217

(34)^ Park, Jin; Lee, Young; Kim, Young; -1#Myung, Hwan Na et al. (2013). Y-SNP miniplexes for East Asian Y-chromosomal haplogroup determination in degraded DNA. Forensic Science International: Genetics 7: 7581. doi:10.1016/j.fsigen.2012.06.014. 

(35)^ Zhong, Hua; Shi, Hong; Xue-, XB; Qi, Bin; Jin, L; Ma, RZ; Su, B (2010). Global distribution of Y-chromosome haplogroup C reveals the prehistoric migration routes of African exodus and early settlement in East Asia. Journal of Human Genetics 55 (7): 42835. doi:10.1038/jhg.2010.40. PMID 20448651. 

(36)^ abcdefghijklmnopqrFamilyTreeDNAC-M217

(37)^ abcdefghijTheYtreeC2-M217

(38)^ https://www.23mofang.com/ancestry/family/5ca2d9a1e4b02c383c387382

(39)^ Lan-Hai Wei, Yun-Zhi Huang, Shi Yan, et al., "Phylogeny of Y-chromosome haplogroup C3b-F1756, an important paternal lineage in Altaic-speaking populations." Journal of Human Genetics advance online publication, 1 June 2017; doi:10.1038/jhg.2017.60

(40)^ https://www.23mofang.com/ancestry/ytree/C-F1319/detail

(41)^ https://www.23mofang.com/ancestry/ytree/C-MF1955/detail

(42)^ https://www.23mofang.com/ancestry/ytree/C-MF3000/detail

(43)^ https://www.familytreedna.com/public/chaplogroup/default.aspx?section=yresults

(44)^ https://www.23mofang.com/ancestry/ytree/C-MF1029/detail

(45)^ https://www.23mofang.com/ancestry/ytree/C-F9898/detail

(46)^ Underhill PA, Shen P, Lin AA, et al. (November 2000). Y chromosome sequence variation and the history of human populations. Nat. Genet. 26 (3): 35861. doi:10.1038/81685. PMID 11062480. 

(47)^ https://www.23mofang.com/ancestry/ytree/C-CTS4660/detail

(48)^ Boris Malyarchuk, Miroslava Derenko, Galina Denisova, Marcin Wozniak, Tomasz Grzybowski, Irina Dambueva, and Ilia Zakharov, "Phylogeography of the Y-chromosome haplogroup C in northern Eurasia." Annals of Human Genetics (2010) 74, 539546. doi: 10.1111/j.1469-1809.2010.00601.x

(49)^ Yan S, Wang C-C, Zheng H-X, Wang W, Qin Z-D, et al. (2014) "Y Chromosomes of 40% Chinese Descend from Three Neolithic Super-Grandfathers." PLoS ONE 9(8): e105691. doi:10.1371/journal.pone.0105691

(50)^ Jin Sun, Peng-Cheng Ma, Hui-Zhen Cheng, Chi-Zao Wang, Yong-Lan Li, Yin-Qiu Cui, Hong-Bin Yao, Shao-Qing Wen, Lan-Hai Wei (2020) Post-last glacial maximum expansion of Y-chromosome haplogroup C2a-L1373 in northern Asia and its implications for the origin of Native Americans American Journal of Physical Anthropology 174(2) 363-374

(51)^ DNA  2009 ISBN 978-4585053941